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STR遺傳標記分析服務

短串聯重複序列(short tandem repeat, STR),也稱微衞星DNA(microsatellite DNA),是指以少數幾個核苷酸(多數為2-6個)為單位多次串聯重複的DNA序列。由於重複單位及重複次數不同,使其分佈具有很大的差異性,構成了STR的遺傳多態性,並按孟德爾規律呈共顯性遺傳。由於STR具有種屬特異性、適合於複合擴增、使其在作物種質鑑定、親緣關係分析、法醫和親子鑑定等領域都得到了廣泛的應用。

STR 作為遺傳標記有以下優點:

l 片段短,可以複合擴增,提高識別能力

l 多態性程度高,等位基因多,鑑別能力強(在每個STR 位點上,多有幾個到幾十個等位片段)

l 適合於陳舊的樣品,檢測能力強

l 靈敏度高,有利於微量樣品的檢測

 

STR檢測的應用:

1 品種鑑定

2 系譜分析

3 法醫及親子鑑定

4 羣體間遺傳距離分析

5 進化和遺傳多樣性研究

 

實驗流程

STR位點序列的獲取→ 基因組DNA提取→ 熒光標記引物設計、合成→ 多重PCR擴增→ 毛細管電泳檢測→ Genemapper軟件分析數據

  



服務特色:

l ABI 3730xl遺傳分析系統,速度快,準確度高

l 自有多種熒光探針合成,使用多熒光+內標的檢測方式,通量大、速度快,並有效保證結果準確性

l ABI GeneMapper 4.0或Genemarker軟件自動完成數據獲取和處理分析,為後期結果分析提供可靠數據

l 大批量樣品,可免費代為PCR擴增

 

服務方案:

l 跑板:客户提供特異性擴增的PCR產物及PCR鑑定電泳圖,將PCR產物上機檢測並軟件自動讀取實驗結果,提供原始實驗結果及簡單結果分析

l STR全套實驗服務:根據客户實驗需求,選取合適的STR位點、設計引物,並進行預實驗以優化出的最佳實驗方案。熒光修飾引物合成,根據優化方案進行正式STR擴增和檢測實驗,將數據進行分析整理,形成最終報告提交客户。

 

客户提供STR位點信息:

STR位點上下游各250bp序列,重複單位個數相關信息

 

STR分析所需樣品的要求:

l DNA樣品:濃度≥20ng/ul,體積≥10ul(若位點數較多,則按1ul/位點準備),純度OD 260/280在1.7~1.9 之間。如果客户要求提供樣品純化服務,我們將收取純化費;

l 96孔板寄送DNA樣品時,請用硅膠墊蓋緊,並用錫紙包裹,以免樣品滲漏或者熒光衰減;

l 血液樣品:體積大於500ul,用EDTA抗凝,送樣過程中請注意保持低温,防止DNA降解;

l 血斑樣品:9-25mm2大小的血斑兩個以上。對每個血樣或血斑樣本將收取DNA 提取費。若分型樣品為細胞、組織樣品,樣本要求:細胞≥105,組織≥100mg,黃豆大小;

l 寄送樣品時,請在送樣包裹中放置足量的冰袋,以減少在運輸過程中因温度變化導致DNA降解的可能。

 

檢測週期

常規檢測任務1-3周內完成,具體時間根據STR位點及樣本數而定。

 

我們提交結果

l Genemapper分析圖譜(PDF格式)及原始fsa格式峯型圖

l 各峯的相對分子量等具體信息(Excel格式)

l 完整實驗報告(包括引物序列、擴增反應體系,實驗步驟等)

l 數據分析軟件及使用説明

 

聯繫方式

郵箱:snp@generay.com.cn

電話:021-67840429

 


友情鏈接://www.hstbio.cn

 

  

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